Dentro de los antídotos fisiológicos tenemos dos tipos:
a) Antagonistas de los efectos tóxicos:

• Naloxone (en sobredosis de opiáceos)
• Atropina y oximas (en intoxicación por insecticidas organofosforados).
• Vitamina K (en intoxicación por cumarinas).
• Fisostigmina (en intoxicación por fenotiazinas, antidepresivos tricíclicos y otras sustancias anticolinérgicas).
• Difenhidramina (en intoxicaciones por fenotiazinas, butirofenonas y demás neurolépticos).
• Alcohol etílico (en intoxicaciones por metanol o etilenglicol).

b) Sustancias que aportan el metabolito cuyo déficit ha sido generado por el tóxico:

• GSH (en intoxicación por paracetamol).
• N-acetilcisteína (en intoxicación por paracetamol).
• Tetrahidrofolato (en intoxicación por metrotexato, citostático que actúa inhibiendo la dihidrofolato reductasa).
• Azul de metileno (en intoxicaciones por sustancias metahemoglobinizantes: fenacetina, sulfonamida, etc.).
• Gluconato cálcico (en intoxicaciones por etilenglicol o ácido fluorhídrico).
• Nitrito sódico + Tiosulfato sódico (en intoxicaciones por cianuro).